La coopération transnationale (20 % du budget) sur une échelle plus large, vise à promouvoir des coopérations entre régions voisines appartenant à une même aire géographique, sur des priorités stratégiques de l'Union, telles que la recherche et le développement, la société de l'information, l'environnement, l'enseignement supérieur, la mobilité et le développement urbain durable, ainsi que la gestion des catastrophes naturelles.
Transnational cooperation (20% of the budget), which is carried out on a larger scale, seeks to promote cooperation between neighbouring regions belonging to the same geographical area with the aim of achieving the Union's strategic priorities in areas such as research and development, the information society, the environment, higher education, mobility, sustainable urban development and the management of natural disasters.