La fase successiva della migrazione consisteva nel “popolamento” delle copie nazionali del SIS II per garantire che gli Stati membri con una copia nazionale del SIS II disponessero degli stessi dati contenuti nella banca dati centrale del SIS II. Tale processo non è necessario per i sei Stati membri che avevano deciso di non applicare una copia nazionale e di effettuare tutte le interrogazioni sul sistema centrale, una nuova funzionalità introdotta dal SIS II.
La phase suivante de la migration a consisté à «remplir» les copies nationales du SIS II pour faire en sorte que les États membres ayant une copie nationale du SIS II disposent des mêmes données que celles qui figuraient dans la base de données centrale du SIS II. Cette phase n’a pas été nécessaire pour les six États membres qui avaient décidé de ne pas mettre en place une copie nationale et d’effectuer toutes les interrogations dans le système central, ce qui correspond à une nouvelle fonctionnalité introduite par le SIS II.
