Il nuovo protocollo conferma la clausola di esclusività, che figurava anche nel testo dell'accordo, e contiene una precisazione più accurata del contenuto della clausola di sospensione e revisione del pagamento della contropartita finanziaria e di sospensione dell'applicazione del protocollo in determinate circostanze, segnatamente in caso di violazione degli elementi essenziali dei diritti umani come previsto all'articolo 9 dell'accordo di Cotonou (articoli 8 e 9 del nuovo protocollo).
La clause d'exclusivité, qui existait déjà dans le texte de l'accord, est toujours présente dans le nouveau protocole et le contenu des clauses de suspension et de révision du paiement de la contrepartie financière et de suspension de l'application du protocole dans certaines circonstances, notamment en cas de violation des éléments essentiels des droits de l'homme, conformément à l'article 9 de l'Accord de Cotonou (article 8 et article 9 du nouveau protocole), y est mieux décrit.